Katdera Chorób Zakaźnych jest bezpośrednim następcą Oddziału Chorób Zakaźnych Szpitala im. św. Łazarza, którego Prymariuszem (Ordynatorem) od 5.10.1917 roku był Profesor dr Józef Kostrzewski. Po utworzeniu Akademii Medycznej w Krakowie w 1951 roku, Oddział Zakaźny przemianowano na Katedrę i Klinikę Chorób Zakaźnych i Epidemiologii Akademii Medycznej w Krakowie. W trakcie kolejnych lat struktura i nazwa Katedry zmieniała się, a w chwili obecnej jako Katedra Chorób Zakaźnych jest częścią Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Medicum.